Уже каменная церковь апостола Якова (Иакова) на Яковлеве улице (в Неревском конце) впервые упоминается в Новгородской Первой летописи под 1172 годом. В дальнейшем церковь неоднократно горит в пожарах и перестраивается. По Семисоборной росписи (XV в.) была соборной, в округ Яковлевского собора кроме него входило 6 церквей (севернее Розважи до вала Окольного города).
С 1732 года собор приходит в запустение, отсутствие прихода лишило его содержания. В 1837 году храм упразднен, а в 1846 г. он «обрушился сам собою».
Иллюстрации: рисунок Н. А. Мартынова (первая половина XIX века); церковь Апостола Якова на плане 1846 года под номером 59; двор дома № 5 по Яковлевой улице; место церкви на современной карте